代謝シグナルが投射されるゲノム領域の同定と転写環境調節機構の解明
研究組織
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矢作 直也（やはぎ なおや） 筑波大学大学院人間総合科学研究科 准教授 HP: http://metab.umin.ne.jp/ E-mail: nyahagi-tky::umin.ac.jp |
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研究概要
代謝シグナルを受けた遺伝子発現制御機構の中で、転写因子が特定のゲノムDNA配列を読み取る「目」となって作用するには、ゲノムの特定の場所で複数の核内因子と複合体を構成することが重要である。
研究代表者らは、エネルギー代謝シグナルの解析のための個体を用いたアッセイ系として、肝臓へのアデノウイルスによるルシフェラーゼレポーター遺伝子の導入と生体イメージング(IVIS)を組み合わせた定量系 (in vivo Ad-luc解析法)を確立してきた。さらに最近我々は、ゲノム上の全転写因子を網羅する発現ライブラリー (TFEL：Transcription Factor Expression Library) を独自に開発し、それを用いた転写複合体解析法(TFEL scan法)を確立した。
本研究では、in vivo Ad-luc解析法により、様々なエネルギー代謝シグナルが投射されるゲノム上の領域を同定を進め、そこに我々独自のTFEL scan転写複合体解析法を組み合わせることにより、その領域上におけるエピゲノム情報を含めた転写環境制御機構の解明を目指す。
最近の論文
- Izumida, Y., *Yahagi, N., Takeuchi ,Y., Nishi, M., Shikama, A., Takarada, A., Masuda, Y., Kubota, M., Matsuzaka, T., Nakagawa, Y., Iizuka, Y., Itaka, K., Kataoka, K., Shioda, S., Niijima, A., Yamada, T., Katagiri, H., Nagai, R., Yamada, N., Kadowaki, T., and Shimano H.
Glycogen shortage during fasting triggers liver-brain-adipose neurocircuitry to facilitate fat utilization.
Nature Commun. 4, Article number 2316 (2013)
- Kumadaki, S., Karasawa, T., Matsuzaka, T., Ema, M., Nakagawa, Y., Nakakuki, M., Saito, R., Yahagi, N., Iwasaki, H., Sone, H., Takekoshi, K., Yatoh, S., Kobayashi, K., Takahashi, A., Suzuki, H., Takahashi, S., Yamada, N., and *Shimano, H.
Inhibition of ubiquitin ligase F-box and WD repeat domain-containing 7α (Fbw7α) causes hepatosteatosis through Krüppel-like factor 5 (KLF5)/peroxisome proliferator-activated receptor γ2 (PPARγ2) pathway but not SREBP-1c protein in mice.
J. Biol. Chem. 286, 40835-40846 (2011)
主要論文
- Takeuchi, Y., *Yahagi, N., Izumida, Y., Nishi, M., Kubota, M., Teraoka, Y., Yamamoto, T., Matsuzaka, T., Nakagawa, Y., Sekiya, M., Iizuka, Y., Ohashi, K., Osuga, JI., Gotoda, T., Ishibashi, S., Itaka, K., Kataoka, K., Nagai, R., Yamada, N., Kadowaki, T., and Shimano, H.
Polyunsaturated fatty acids selectively suppress sterol regulatory element-binding protein-1 through proteolytic processing and autoloop regulatory circuit.
J. Biol. Chem. 285, 11681-11691 (2010) - Inoue, N., Yahagi, N., Yamamoto, T., Ishikawa, M., Watanabe, K., Matsuzaka, T., Nakagawa, Y., Takeuchi, Y., Kobayashi, K., Takahashi, A., Suzuki, H., Hasty, AH., Toyoshima, H., Yamada, N., and *Shimano, H.
Cyclin-dependent kinase inhibitor, p21WAF1/CIP1, is involved in adipocyte differentiation and hypertrophy, linking to obesity and insulin resistance.
J. Biol. Chem. 283, 21220-21229 (2008) - Takeuchi, Y., Yahagi, N., Nakagawa, Y., Matsuzaka, T., Shimizu, R., Sekiya, M., Iizuka, Y., Ohashi, K., Gotoda, T., Yamamoto, M., Nagai, R., Kadowaki, T., Yamada, N., Osuga, JI., and *Shimano, H.
In vivo promoter analysis on refeeding response of hepatic sterol regulatory element-binding protein-1c expression. Biochem. Biophys. Res. Commun. 363, 329-335 (2007) - Sekiya, M., Yahagi, N., Matsuzaka, T., Takeuchi, Y., Nakagawa, Y., Takahashi, H., Okazaki, H., Iizuka, Y., Ohashi, K., Gotoda, T., Ishibashi, S., Nagai, R., Yamazaki, T., Kadowaki, T., Yamada, N., Osuga, JI., and *Shimano, H.
Sterol regulatory element-binding protein (SREBP) -1-independent regulation of lipogenic gene expression in adipocytes.
J. Lipid Res. 48,1581-1591 (2007) - Matsuzaka, T., *Shimano, H., Yahagi, N., Kato, T., Atsumi, A., Yamamoto, T., Inoue, N., Ishikawa, M., Okada, S., Ishigaki, N., Iwasaki, H., Iwasaki, Y., Karasawa, T., Kumadaki, S., Matsui, T., Sekiya, M., Ohashi, K., Hasty, AH., Nakagawa, Y., Takahashi, A., Suzuki, H., Yatoh, S., Sone, H., Toyoshima, H., Osuga, JI., and Yamada, N.
Crucial role of a long-chain fatty acid elongase, Elovl6, in obesity-induced insulin resistance.
Nat. Med. 13, 1193-1202 (2007) - Nakagawa, Y., *Shimano, H., Yoshikawa, T., Ide, T., Tamura, M., Furusawa, M., Yamamoto, T., Inoue, N., Matsuzaka, T., Takahashi, A., Hasty, AH., Suzuki, H., Sone, H., Toyoshima, H., Yahagi, N., and Yamada, N.
TFE3, a novel transcription factor for hepatic IRS-2 and insulin signals, ameliorates diabetes.
Nat. Med. 12, 107-113 (2006) - Najima, Y., Yahagi, N., Takeuchi, Y., Matsuzaka, T., Sekiya, M., Nakagawa, Y., Amemiya-Kudo, M., Okazaki, H., Okazaki, S., Tamura, Y., Iizuka, Y., Ohashi, K., Harada, K., Gotoda, T., Nagai, R., Kadowaki, T., Ishibashi, S., Yamada, N., Osuga, JI., and *Shimano, H.
High mobility group protein-B1 (HMGB1) interacts with sterol regulatory element-binding proteins (SREBPs) to enhance their DNA binding.
J. Biol. Chem. 280, 27523-27532 (2005) - Ide, T., *Shimano, H., Yahagi, N., Matsuzaka, T., Nakakuki, M., Yamamoto, T., Nakagawa, Y., Takahashi, A., Suzuki, H., Sone, H., Toyoshima, H., Fukamizu, A., and Yamada, N.
SREBPs suppress IRS-2-mediated insulin signalling in the liver.
Nat. Cell Biol. 6, 351-357 (2004) - Yahagi, N., *Shimano, H., Matsuzaka, T., Sekiya, M., Najima, Y., Okazaki, S., Okazaki, H., Tamura, Y., Iizuka, Y., Inoue, N., Nakagawa, Y., Takeuchi, Y., Ohashi, K., Harada, K., Gotoda, T., Nagai, R., Kadowaki, T., Ishibashi, S., Osuga, JI., and Yamada, N.
p53 involvement in the pathogenesis of fatty liver disease.
J. Biol. Chem. 279, 20571-20575 (2004) - Yahagi, N., *Shimano, H., Matsuzaka, T., Najima, Y., Sekiya, M., Nakagawa, Y., Ide, T., Tomita, S., Okazaki, H., Tamura, Y., Iizuka, Y., Ohashi, K., Gotoda, T., Nagai, R., Kimura, S., Ishibashi, S., Osuga, JI., and Yamada, N.
p53 activation in adipocytes of obese mice.
J. Biol. Chem. 278, 25395-25400 (2003)